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Replicação: Mecanismo e enzimologia Física-médicaFísica-médica 2011 A fiel transmissão da informação hereditária depende da replicação precisa do material genético 1958 – Matthew Meselson e Franklin Stahl Gradiente de cloreto de césio Ausência de DNA 15N indica que o DNA parental não era preservado como uma unidade na replicação. Cresceram células de E. coli. � Replicação semiconsevativa Cada dúplex filha contém um filamento parental e um recém-sintetizado. A natureza semi-conservativa da replicação do DNA Os dois filamentos da dupla hélice parental se desenrolam, e são gerados dois novos filamentos filhos pela regra de pareamento de base. John Cairns Sintetizou DNA radioativo de E. coli crescendo células em meio contendo timidina marcada com trítio (3H). Duas forquilhas de replicação movendo-se em direções opostas no cromossoma circular Uma "bolha" de replicação pode ter uma ou duas forquilhas. Se tiver apenas uma forquilha significa que a replicação é unidirecional e se tiver duas forquilhas a replicação é bidirecional. Origem de replicação em procariotos Origem de replicação - Regiões ricas em A-T que são reconhecidas por complexos protéicos Origem de replicação em eucariotos INÍCIO DA REPLICAÇÃO •A replicação inicia-se nas ORIGENS DE REPLICAÇÃO, que são sequências específicas muito ricas em pares A=T E.coli – 1 origem de replicaçãoE.coli – 1 origem de replicação Eucariotas - múltiplas origens de replicação localizadas ao longo do cromossomo A química da síntese do DNA Síntese de DNA catalisada por DNA polimerase Um modelo incorreto para a replicação do DNA correto incorreto Estrutura da forquilha de replicação do DNA Fita continua Fita descontínua Fita descontínua � A Replicação é muito acurada Alto grau de fidelidade Em E. coli um erro é feito apenas uma vez para cada 109 ou 1010 nucleotídeos adicionados. Como seu cromossomo tem ~4,6 x 106 pb, isto significa que ocorre um erro a cada 1.000 ou 10.000 replicações. A discriminação entre os nucleotídeos corretos e incorretos depende não apenas das pontes de hidrogênio entre bases complementares, mas também da sua geometria. Correção exonucleásica pela DNA polimerase durante a replicação do DNA Exonuclease de correção cliva qualquer nucleotídeo (nt) não pareado (na extremidade do iniciador) continuando até que um número suficiente de nt tenha sido removido para regenerar uma extremidade 3´OH. Dessa forma a DNA polimerase atua como uma enzima de autocorreção que remove os próprios erros à medida que se move pelo DNA. DNA polimerase DNAs Polimerases Função Exonucleásica 5´- 3´ Exonucleásica 3´- 5´ Pol I (polA) Reparo e junção de os fragmentos de DNA SIM SIM Pol II (polB) Reparo NÃO SIM Pol III (polC) Reparo e Síntese do DNA NÃO SIM α τ τ α β β β β DNA pol III Subunidade α – sítio catalítico Subunidade β – sítio de ligação ao DNA Subunidade τ – mantém a estrutura Início da síntese de DNA por um primer (iniciador) de RNA DNA primase = utiliza ribonucleosídeos trifosfatos para sintetizar pequenos iniciadores de RNA. O papel e a estrutura de uma DNA HELICASE O papel das topoisomerases (Tipo I) 1) Clivagem de um filamento de DNA. 2) DNA pode girar em relação a outro, aliviando a tensão acumulada. 3) Ressoldagem da quebra no DNA. (Tipo II) O papel das proteínas SSB (single-strand binding protein) na estrutura do DNA fita simples Síntese de um dos vários fragmentos na fita descontínua (Fragmentos de OKAZAKI). Segmentos intermediários que são polimerizados apenas na cadeia de direção 5´-3´ e são unidos após sua síntese, formando longas cadeias de DNA. Formação dos fragmentos de Okazaki Reação catalisada pela DNA LIGASE SLIDING CLAMP (cinta deslizante) que segura a DNA polimerase na fita de DNA Fita contínua Fita descontínua O papel das histonas durante o processo de replicação. A replicação das pontas do cromossoma de eucariotos TELOMERASE Término da Replicação 1- Quando 2 forquilhas se encontram 2- Proteínas se ligam a sequências de término 2- Proteínas se ligam a sequências de término presentes no DNA bloqueando a ação da DNApol III Replicação Eucariotos x Procariotos Principais Diferenças PROCARIOTOS EUCARIOTOS 1 origem de replicação Várias origens de replicação 3 DNApol principais + de 5 DNApol3 DNApol principais + de 5 DNApol Não tem nucleossomos Desmontagem e remontagem dos nucleossomo Não tem telomero Telomerase sintetiza extremidades dos cromossomos (telomero) A Replicação 5´ 3´ 3´ 5´ Origem de Replicação 3´ 5´ A Replicação 5´ 3´ 3´ 5´ Origem de Replicação 3´ 5´ Proteínas iniciadoras A Replicação 5´ 3´5´ 3´ 3´ 5´ 5´ 3´ Uma pequena parte do DNA se deselicoidiza 5´ 3´ A Replicação Forquilha de Replicação 3´ 3´ 5´ Helicase SSB (single stranded binding protein) 5´ 3´ 5´ Helicase Sentido da forquilha A Replicação Primase (RNApol) 3´ 5´ Helicase 5´ 3´ SSB 5´ 3´ 5´ Sentido da forquilha A Replicação DNA pol III 3´ 5´ 5´ 3´ topoisomerase 5´ 3´ 5´ Sentido da forquilha A Replicação 3´ 5´ 5´ 3´ Sentido da DNA pol III topoisomerase Fita Líder Replicação Contínua 5´ 3´ 5´ Sentido da forquilha Primase 5´3´ A Replicação 3´ 5´ 5´ 3´ topoisomerase 5´ 3´ 5´ Sentido da forquilha 5´ 3´ DNA pol III A Replicação 3´ 5´ 5´ 3´ topoisomerase 5´ 3´ 5´ Sentido da forquilha 5´ 3´ Sentido da DNA pol III A Replicação 3´ 5´ 5´ 3´ topoisomerase Primase 5´3´ 5´ 3´ 5´ 5´ 3´ Sentido da forquilha A Replicação Fita Atrasada 3´ 5´ 5´ 3´ Fita Líder 5´ 5´ 3´ 5´ 5´3´ 3´ DNA pol III Sentido da forquilha A Replicação Fita Atrasada Replicação Descontínua 3´ 5´ 5´ 3´ Fita Líder 5´ 5´ 3´ 5´ 5´3´ 3´ Fragmentos de Okazaki Sentido da forquilha A Replicação 3´ 5´ 5´ 3´ Fragmentos de Okazaki DNA pol I 5´ 5´ 3´ 5´ 5´3´ 3´ Sentido da forquilha A Replicação 3´ 5´ 5´ 3´ 5´ 5´ 3´ 5´ 3´ 3´5´ Sentido da forquilha A Replicação 3´ 5´ 3´ 5´ 5´ 5´ 3´ 5´ 3´ 3´5´ DNA ligase Sentido da forquilha A Replicação 3´ 5´ 5´ 3´ 5´ 5´ 3´ 5´ 3´ Sentido da forquilha A Replicação 3´ 5´ 3´ 5´ 5´ 5´ 3´ 5´ 5´3´ Fita atrasada 3´ DNA pol III Sentido da forquilha A Replicação 3´ 5´ 5´ 3´ Fita lider DNA pol III