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Professor Alexandre Soares dos Santos DCB/UFVJM 2007 1 Nucleotídeos e Ácidos Nucléicos: estrutura e propriedades Professor Alexandre Soares dos Santos DCB/UFVJM 2007 2 Importância dos Nucleotídeos 1- Precursores ativados para síntese de DNA e RNA; 2- Intermediários ativados em rotas biossintéticas: UDP-glicose, CDP- diacilglicerol; 3- Moléculas armazenadoras de energia: ATP e GTP; 4- Componentes de coenzimas (adenina): NAD+, FAD e CoA; 5- Reguladores metabólicos: AMPc e ATP. ____________________________________________________________________ Bases Nitrogenadas Anel Pirimidina Anel Purina Timina (T) Citosina (C) Uracil (U) Adenina (A) Guanina (G) Tautomerismo ceto-enólico Uracil (anel lactâmico) Uracil (anel lactímico) Professor Alexandre Soares dos Santos DCB/UFVJM 2007 3 Pentoses dos nucleotídeos D-Ribose D-2-Deoxirribose ______________________________________________________ Nucleosídeos: • formados pela junção de uma base nitrogenada com uma pentose Citidina: Formada pela ligação entre a OH do C1 de uma ribose e o N1 da base nitrogenada citosina. Citidina Timidina Adenosina Guanosina Conformação syn Guanosina anti Guanosina Professor Alexandre Soares dos Santos DCB/UFVJM 2007 4 Nucleotídeos são fosfatos de nucleosídeos Guanosina-5’-monofosfato (5’-GMP) Ácido Guanílico 3’,5’-monofosfato de guanosina cíclico (3’,5’-cGMP) Sumário Base Nucleosídeo Nucleotídeo RNA (mono-Pi) DNA (mono-Pi) Código Adenina (deoxi-)Adenosina Ácido (deoxi-)Adenílico AMP dAMP A Guanina (deoxi-)Guanosina Ácido (deoxi-)Guanílico GMP dGMP G Citosina (deoxi-)Citidina Ácido (deoxi-)Citidílico CMP dCMP C Timina Timidina Ácido Timidílico dTMP T Uracil Uridina Ácido Uridílico UMP U Professor Alexandre Soares dos Santos DCB/UFVJM 2007 5 Trifosfatos de Nucleosídeos Trifosfato de Adenosina (ATP) Oligonucleotídeos Ligações fosfodiester 3’Æ 5’ Professor Alexandre Soares dos Santos DCB/UFVJM 2007 6 Alongamento e Emparelhamento do DNA Extremidade 3’ Professor Alexandre Soares dos Santos DCB/UFVJM 2007 7 Características do DNA e RNA Professor Alexandre Soares dos Santos DCB/UFVJM 2007 8 Comparação entre DNA e RNA Função dos Ácidos Nucléicos Professor Alexandre Soares dos Santos DCB/UFVJM 2007 9 SÍNTESE DE NUCLEOTÍDEOS PURÍNICOS • Síntese “de novo” (a partir de precursores simples: aminoácidos, derivados de tetra-hidrofolato, NH4+ e CO2) • Síntese de poupança ou de recuperação (a partir de reciclagem de bases oriundas da degradação de ácidos nucléicos) Síntese de novo (11 etapas) 1ª ETAPA: Ribose-5-fosfato + ATP ⇒ 1-pirofosfato-α-5-fosforibose (PRPP) + AMP 2ª ETAPA: PRPP + Glutamina ⇒ 5-fosfo-β-D-ribosilamina + glutamato 3ª ETAPA: 5-fosfo-β-D-ribosilamina + glicina + ATP ⇒ glicinamida ribonucleotídeo (GAR) 4ª ETAPA: glicinamida ribonucleotídeo (GAR) + N10-formil-tetraidrofolato ⇒ FGAR 5ª ETAPA: FGAR + glutamina + ATP ⇒ formilglicinamidina ribonucleotídeo (FGAM) + glutamato + ADP Doador de OSE ativado Professor Alexandre Soares dos Santos DCB/UFVJM 2007 10 6ª ETAPA: FGAM + ATP ⇒ 5-aminoimidazol ribonucleotídeo (AIR) + H2O Obs.: formação do primeiro anel (5 átomos) 7ª ETAPA: AIR + CO2 (HCO3-) ⇒ 5-amino-4-carboxiamino-imidazol ribonucleotídeo 8ª ETAPA: 5-amino-4-carboxiamino-imidazol ribonucleotídeo + ATP + aspartato ⇒ N-succinilo-5-aminoimidazol-4-carboxiamida ribonucleotídeo (SAICAR) 9ª ETAPA: SAICAR ⇒ fumarato + 5-aminoimidazol-4-carboxiamida-imidazol ribonucleotídeo (AICAR) 10ª ETAPA: AICAR + N10-formil-tetraidrofolato ⇒ tetraidrofolato + N- formilaminoimidazol-4-carboxiamida ribonucleotídeo (FAICAR) 11ª ETAPA: FAICAR ⇒ inosinato (IMP) + H2O INOSINATO (IMP) Precursor do AMP e GMP Professor Alexandre Soares dos Santos DCB/UFVJM 2007 11 OBSERVAÇÕES: • Grupos NH2 de adenina e guanina originam-se de Asp e Gln • Síntese de AMP requer GTP e a síntese de GTP requer ATP • Gasto considerável de energia (AMP = 8 ATP e GMP = 9 ATP) • Rotas metabólicas longas e complexas Professor Alexandre Soares dos Santos DCB/UFVJM 2007 12 Regulação da Biossíntese de IMP, GMP e AMP 1ª etapa da síntese de novo 2ª etapa da síntese de novo Professor Alexandre Soares dos Santos DCB/UFVJM 2007 13 SÍNTESE DE NUCLEOTÍDEOS DE PIRIMIDINA Anel pirimidínico é montado antes de ser incorporado à pentose Aspartato N-carbamilaspartato Diidroorotato Orotato Orotidina-5-fosfato (OMP) Uridina-5-fosfato (UMP) Uridina-5-trifosfato (UTP) Citidina-5-trifosfato (CTP) Carbamil fosfato (precursor) Aspartato-transcarbamoilase Diidroorotase Diidroorotase-desidrogenase Orotato-fosforribosil-transferase Oritidina-5-fosfato-descarboxilase Nucleotídeo -quinase CTP-sintase H2O CO2 NADH + H+ PRPP NAD+ 2 x ATP 2 x ADP Professor Alexandre Soares dos Santos DCB/UFVJM 2007 14 Professor Alexandre Soares dos Santos DCB/UFVJM 2007 15 Redução de ribonucleotídeos para desoxirribonucleotídeos ADP, GDP, CDP e UDP são reduzidos a dADP, dDP, dCDP e dUDP pela Ribonucleosídeo difosfato redutase. Esquema da síntese de nucleotídeos purínicos e pirimidínicos NADPH + H+ NADP+ TR (-S-S-) oxidada TR (-SH)2 reduzida NDP dNDP Ribonucleotídeo redutase Tiorredoxina redutase Professor Alexandre Soares dos Santos DCB/UFVJM 2007 16 Degradação de Nucleotídeos PURINAS • GMP ⇒ guanosina ⇒ guanina *⇒* xantina • AMP ⇒ adenosina ⇒ inosina ⇒ hipoxantina *⇒* xantina • Enzima chave: xantina oxidase (Mb, Fe-S) • Xantina ⇒ ácido úrico Hiperurecemia: acúmulo de ácido úrico (urato de sódio > 7mg/dL) Æ Gota Aluporinol ⇒ inibe a xantina oxidase Vias de recuperação • Adenina + PRPP ⇒ AMP + PPi (Adenosil fosforribosiltransferase) • Guanina + PRPP ⇒ IMP + PPi • Hipoxantina + PRPP ⇒ GMP + PPi (Hipoxantina-guanina fosforribosiltransferase) Síndrome de Lesch-Nyhan (deficiência na Hipoxantina-guanina fosforribosiltransferase) Æ automutilação, agressividade, calculo renal e gota. PIRIMIDINAS • Citosina ⇒ uracila ⇒ diidrouracila ⇒ N-carbamoilpropionato ⇒ NH4+, CO2 e alanina • Timina ⇒ aldeído metilmalônico ⇒ metilmalonil-CoA ⇒ succinil- CoA Professor Alexandre Soares dos Santos DCB/UFVJM 2007 17 Degradação de nucleotídeos purínicos Professor Alexandre Soares dos Santos DCB/UFVJM 2007 18 Degradação de Nucleotídeos Pirimidínicos