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ORGANIZAÇÃO GÊNICA E GENÔMICA DE PROCARIOTOS E EUCARIOTOS Ribossomos Nucleoide (DNA compactado) Pili Flagelo Envelope celular (membrana) ORGANIZAÇÃO GÊNICA E GENÔMICA DE PROCARIOTOS E EUCARIOTOS PROCARIOTOS – organismos unicelulares - ausência de núcleo material genético (DNA) compactado em uma região chamada nucleóide. ORGANIZAÇÃO GÊNICA E GENÔMICA DE PROCARIOTOS E EUCARIOTOS EUCARIOTOS - NÚCLEO bem definido, organelas, material genético compactado no núcleo, cromossomos lineares. ORGANIZAÇÃO GÊNICA E GENÔMICA DE PROCARIOTOS E EUCARIOTOS GENOMAS PROCARIÓTICOS Genoma: conjunto completo de genes e de sequências intergênicas de todos os cromossomos de uma célula. Bactéria típica: - genoma em um CROMOSSOMO ÚNICO (haplóides) - uma molécula de DNA dupla fita - CIRCULAR (exceções: lineares) - tamanho do GENOMA muito MENOR do que eucariotos procariotos: 0,6 X 106pb a 9,5 X 106pb (pares de bases) menor genoma eucarioto: 13 X 106pb (levedura) bactéria plasmídeo cromossomo ORGANIZAÇÃO GÊNICA E GENÔMICA DE PROCARIOTOS E EUCARIOTOS GENOMA COMPACTO com poucos ou nenhum espaço entre os genes (sequências intergênicas). tamanho do genoma está relacionado com o número de genes. Não há redundância significativa – maioria dos GENES presentes em apenas UMA CÓPIA no genoma. (exemplo de gene redundante em E. coli – genes do rRNA – 7 cópias). Poucas sequências repetidas – menos de 2% do genoma bacteriano. PLASMÍDEO - DNA extra-cromossomal com capacidade de replicação autônoma (1.000 a 200.000 pares de base) – CIRCULAR - várias cópias ou cópia única – vantagens adaptativas (resistência à antibióticos). GENOMAS PROCARIÓTICOS ORGANIZAÇÃO GÊNICA E GENÔMICA DE PROCARIOTOS E EUCARIOTOS ORGANIZAÇÃO GÊNICA E GENÔMICA DE PROCARIOTOS E EUCARIOTOS GENE – toda a seqüência nucleotídica necessária e suficiente para a síntese de um polipeptídeo ou de uma molécula de RNA estável (p. ex. rRNA ou tRNA). Região codificadora seqüência nucleotídica que codifica a seqüência de aminoácidos de uma cadeia polipeptídica ou um RNA estável. Região reguladora determina e controla a transcrição. região reguladora região codificadora DNA 5’ 5’ 3’ 3’ 5’ 3’ RNA PROTEÍNA Fita codificadora Fita molde Fita codificadora – fita do DNA cuja seqüência encontra-se representada no RNA. Fita molde – fita do DNA que serve de molde para a síntese do RNA. ORGANIZAÇÃO GÊNICA E GENÔMICA DE PROCARIOTOS E EUCARIOTOS GENE PROCARIÓTICO região reguladora região codificadora DNA 5’ 5’ 3’ 3’ UAS Promotor/ operador Sí ti o d e in íc io d a tr an sc ri çã o Sí ti o d e té rm in o d a tr an sc ri çã o RNA 5’ 3’ Sí ti o d e in íc io d a tr ad u çã o Sí ti o d e té rm in o d a tr ad u çã o região codificadora PROTEÍNA TRANSCRIÇÃO TRADUÇÃO 5’UTR (Região 5’ não traduzida) 3’UTR (Região 3’ não traduzida) Promotor – local no DNA onde se liga a RNA polimerase (síntetiza o RNA). Operador – local de ligação de proteínas repressoras da transcrição. UAS – “upstream activator sequence” – sítio de ligação para proteínas ativadoras da transcrição. Terminador – local onde ocorre o desligamento da RNA polimerase – final da transcrição. ORGANIZAÇÃO GÊNICA E GENÔMICA DE PROCARIOTOS E EUCARIOTOS Características típicas de genes procarióticos: Organização de genes em OPERONS OPERON - 2 ou mais genes que codificam produtos com funções relacionadas (p.ex. mesma rota metabólica) ocupam posições adjacentes e estão sob controle de uma única região reguladora. P O gene A gene B gene C OPERON Região reguladora (promotor/operador) TRANSCRIÇÃO A B C mRNA policistrônico TRADUÇÃO TRADUÇÃO TRADUÇÃO Proteínas A B C -genes transcritos em um único mRNA. mRNA policistrônico (1 cístron = a 1 gene). Expressão dos genes ao mesmo tempo e nos mesmos níveis. Economia de espaço no genoma. ORGANIZAÇÃO GÊNICA E GENÔMICA DE PROCARIOTOS E EUCARIOTOS GENE EUCARIÓTICO •Regiões reguladoras e codificadoras mais complexas que procariotos. - regiões reguladoras mais extensas; mais seqüências regulatórias, podem conter elementos regulatórios muito distantes da região codificadora. - presença de ÍNTRONS (raros nos procariotots) – seqüência de nucleotídeos que interrompem a região codificadora (ÉXONS). (presentes no DNA, presentes no pré-mRNA, removidos durante o processameto (splicing) que dá origem ao mRNA maduro.) - TAMANHO DOS GENES - em média MAIOR do que procariotos (devido aos íntrons). ORGANIZAÇÃO GÊNICA E GENÔMICA DE PROCARIOTOS E EUCARIOTOS região reguladora região codificadora DNA 5’ 5’ 3’ 3’ Elementos reguladores distais Promotor/ operador início da transcrição término da transcrição pré-mRNA 5’ 3’ PROTEÍNA TRANSCRIÇÃO PROCESSAMENTO/Splicing 5’UTR 3’UTR íntrons éxons éxons 5’ 3’ Éxons unidos Remoção dos íntrons TRADUÇÃO mRNA Geralmente unidades de transcrição individuais – não formam operons GENE EUCARIÓTICO ORGANIZAÇÃO GÊNICA E GENÔMICA DE PROCARIOTOS E EUCARIOTOS GENOMAS EUCARIÓTICOS •DNA nuclear em DOIS ou MAIS CROMOSSOMOS. maioria dos eucariotos DIPLÓIDES leveduras e alguns outros fungos haplóides algumas plantas POLIPLÓIDES •CROMOSSOMOS LINEARES (cada um uma única molécula de DNA). •Número e tamanho dos cromossomos variáveis. •GENOMAS MAIORES que de procariotos. ORGANIZAÇÃO GÊNICA E GENÔMICA DE PROCARIOTOS E EUCARIOTOS Conteúdo de DNA Valor C = conteúdo de DNA por genoma haplóide. Paradoxo do valor C falta de correlação entre o tamanho do genoma e a complexidade das características morfológicas do organismo resultado da presença de sequências repetidas . ORGANIZAÇÃO GÊNICA E GENÔMICA DE PROCARIOTOS E EUCARIOTOS 1% genoma humano = regiões codantes Exons + introns = 25% genoma 30 000 – 40 000 genes >50% genoma = sequências repetidas ORGANIZAÇÃO GÊNICA E GENÔMICA DE PROCARIOTOS E EUCARIOTOS ORGANIZAÇÃO GÊNICA E GENÔMICA DE PROCARIOTOS E EUCARIOTOS GENOMAS EUCARIÓTICOS SEQÜÊNCIAS REPETIDAS Procariotos – menos de 2% do genoma Eucariotos mais simples – 5 a 6% do genoma Eucariotos mais complexos – podem chegar a mais de 70% do genoma DNA satélites – minissatélites e microssatélites – seqüências de DNA altamente repetitivas Elementos de transposição – segmentos lineares de DNA capazes de mudar de posição dentro do genoma. ORGANIZAÇÃO GÊNICA E GENÔMICA DE PROCARIOTOS E EUCARIOTOS PROCARIOTOS EUCARIOTOS Cromossomo circular Cromossomos lineares Ausência de complemento diplóide Diplódes, tetraplóides, hexaplóides, octaplóides Genoma compacto Genoma grande Poucas ou nenhuma seqüências repetidas Muitas seqüências repetidas Genes muito próximos (ausência de seqüências intergênicas) Genes espaçados (presença de seqüências intergênicas) Operon – mRNA policistrônico mRNA monocistrônico Ausência de íntrons (colinearidade) Presença de íntrons