Para identificar o principal fator histórico responsável pela degradação da Mata Atlântica no Brasil, vamos analisar as alternativas: A) A expansão da pecuária extensiva na região amazônica durante o século XX - Embora a pecuária tenha contribuído para a degradação ambiental, a região amazônica não é o foco principal da Mata Atlântica. B) A exploração do pau-brasil e a expansão da agricultura, especialmente da cana-de-açúcar e do café - Esta alternativa menciona a exploração do pau-brasil, que foi um dos primeiros fatores de degradação, além da expansão da agricultura que teve um grande impacto na Mata Atlântica. C) A prática exclusiva de agricultura sustentável pelas populações indígenas - Essa alternativa não é correta, pois as populações indígenas praticavam uma agricultura que respeitava o meio ambiente, e não contribuíram para a degradação. D) A baixa ocupação populacional do litoral brasileiro ao longo da história - Essa alternativa não é verdadeira, pois a ocupação do litoral foi intensa, especialmente com a colonização. E) A preservação integral do bioma por meio de políticas ambientais desde o período colonial - Essa alternativa é incorreta, pois não houve preservação integral, mas sim exploração. Diante da análise, a alternativa correta é: B) A exploração do pau-brasil e a expansão da agricultura, especialmente da cana-de-açúcar e do café.