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UNIVERSIDADE FEDERAL DO TRIÂNGULO MINEIRO Instituto de Ciências Exatas, Naturais e Educação (ICENE) ENZIMAS -Introdução às enzimas-Introdução às enzimas - Como as enzimas funcionam -Cinética Enzimática - Enzimas Regulatórias Enzimas O que são enzimas? Qual a natureza química das enzimas? Importância das enzimas Condições fundamentais da vida: - O organismo deve ser capaz de autorreplicar; - Deve ser capaz de catalisar reações químicas com eficiência e seletividade. Exemplo da sacaroseExemplo da sacarose “Extratos de leveduras podiam fermentar açúcar em álcool” “Toda enzima é uma proteína” “Ligações fracas entre a enzima e seu substrato podem ser usadas para catalisar a reação” Como as enzimas trabalham? As enzimas adequam o ambiente celular para que as reações bioquímicas ocorram. Ou seja: as enzimas são “facilitadores” que criam um ambiente específico no qual uma dada reação se torna energeticamente mais favorável. ? Catalise química Princípios da Catálise Enzimática 1) Aproximação e orientação do substrato 2) Saída de água 3) Estabilização do estado intermediário3) Estabilização do estado intermediário 4) Transferência de grupo O local onde ocorre a reação é chamado de SÍTIO ATIVO. Como as enzimas trabalham? A molécula que se liga ao sítio ativo e sofre a ação da enzima é chamada de SUBSTRATO. A função de um catalisador é aumentar a velocidade de uma reação sem afetar o equilíbrio da mesma. E + S ES EP E + P Por quê não afeta o equilíbrio??? Como as enzimas trabalham? ∆Go’ > 0 reação é termodinamicamente desfavorável; ∆Go’ < 0 reação é termodinamicamente favorável. não indica a velocidade da reação! Como as enzimas trabalham? E n e r g i a L i v r e , G E n e r g i a L i v r e , G Estado de transição Estado de transição a energia de ativação velocidade da reação. A função de um catalisador é aumentar a velocidade de uma reação sem afetar o equilíbrio da mesma. E n e r g i a L i v r e , G E n e r g i a L i v r e , G Sentido da reação Sentido da reação Estado fundamental Estado fundamental Intermediários da reação? A energia de ligação é a maior fonte de energia livre usada pelas enzimas para baixar a energia de ativação das reações. Exemplos de ligações entre enzima-substrato: pontes de hidrogênio, ligações hidrofóbicas, interações iônicas e de Van der Waals. Como as enzimas trabalham? Esta energia de ligação também confere à enzima a ESPECIFICIDADE ao substrato. Velocidade de reação e equilíbrio têm definições termodinâmicas precisas Equilíbrio está ligado à variação de energia livre padrão da reação= ∆Go’ Velocidade está ligada à energia de ativação= ∆G++ R= constante dos gases= T= temperatura absoluta= S P V = k [S]Equação da velocidade K cte de velocidade Equação de Velocidade A partir da teoria do estado de transição pode-se derivar uma expressão relacionando a magnitude da cte de velocidade com a energia de ativação k = KB T e-ΔG++/RT h KB cte Boltzmann h cte Planck ΔG++ Energia de ativação A relação entre a constante de velocidade K e a energia de ativação ∆G++ é inversa e exponencial. Poucos princípios são suficientes para explicar o poder catalítico e a especificidade das enzimas Como as enzimas trabalham? As interações fracas entre enzima e substrato são otimizadas no estado de transição A energia de ligação contribui para a especificidade da reação e a catálise Barreiras para a reação enzimática: -A entropia - A camada de solvatação - A distorção dos substratos- A distorção dos substratos - A necessidade de um alinhamento apropriado dos grupos funcionais catalíticos da enzima As interações também conferem especificidade O que é especificidade? Ribonuclease As enzimas podem ser simples ou associadas a cofatores Íons inorgânicos: Fe2+ Citocromo oxidase Zn2+ Álcool desidrogenase Mg2+ Glicose 6-fosfatase Moléculas orgânicas (coenzimas): GRUPO PROSTÉTICO Quando fortemente associadoMoléculas orgânicas (coenzimas): FAD Coenzima A Tiamina pirofosfato associado Enzima sem cofator = apoenzima Enzima com cofator = holoenzima • Transferência de grupos • Segundos substratos Como as funcionam as coenzimas? Algumas coenzimas são derivadas de vitaminas Cinética enzimática Fatores que alteram a velocidade de uma reação enzimática: Cinética enzimática Fatores que alteram a velocidade de uma reação enzimática: - Temperatura - pH - [ ] enzima - [ ] enzima - [ ] substrato Cinética enzimática Fatores que alteram a velocidade de uma reação enzimática: - Temperatura Qual a temperatura ideal Qual a temperatura ideal para a atividade de uma enzima??? Cinética enzimática Fatores que alteram a velocidade de uma reação enzimática: - pH Qual o pH ideal para a atividade de uma enzima??? Como o pH pode interferir na atividade enzimática? Cinética enzimática Fatores que alteram a velocidade de uma reação enzimática: - Temperatura - pH - [ ] enzima - [ ] substrato- [ ] substrato Substrato cromogênico: A concentração de substrato altera a velocidade das reações catalisadas por enzimas Velocidade inicial Equação de Michaelis-Menten : A relação entre a concentração do substrato e a velocidade da reação pode ser expressa quantitativamentequantitativamente Cinética enzimática Equação de Michaelis-Menten : Saturação dos sítios-ativos Cinética enzimática Vo [S] Duplo recíproco ou Lineweaver-Burk Quais as vantagens do uso do duplo recíproco ? Equação do duplo recíproco : Por quê muitos substratos estão presentes em concentrações muito próximas aos valores de Km das enzimas correspondentes? É uma adaptação evolucional que permite essas enzimas a se ajustarem ao fluxo de vias metabólicas. Por exemplo: ∆ VB A enzima funcionando no máximo de sua atividade ∆S V S ∆ VB A enzima funcionando abaixo da atividade máxima ∆ VA ∆S ∆S V S Como inibir a atividade de uma enzima? Como inibir a atividade de uma enzima? - Temperatura? - pH? - [ ] enzima? - [ ] substrato? Inibição competitiva Como ficaria este gráfico? Inibição competitiva Eficiência Vmax Km = eficiência catalítica Inibição não competitiva Como ficaria este gráfico? O I não competitivo liga-se apenas ao complexo ES!!!!! Inibição não competitiva Inibição Irreversível quimotripsina Inibidores Irreversíveis “Envenenam” Enzimas!!!!!! • Físico • [ ] do substrato • [ ] da enzima • Expressão gênica Mecanismos Regulatórios • Expressão gênica • Alosterismo • Modificações covalentes • Ativação enzimática Mecanismos Regulatórios • Físico • A enzima e o seu substrato devem estar no mesmo compartimento celular. (compartimentalização). As reações catabólicas e anabólicas ocorrem geralmente em diferentes compartimentos celulares. Por exemplo, o catabolismo de ác. graxos ocorre nas mitocôndrias e a síntese de ác. graxos ocorre no citosol. Concentração do substrato Concentração da enzima • Assim como qualquer outra proteína a concentração celular de uma enzima vai depender das taxas de síntese (ks) e degradação (kdeg) Enzima ks kdeg AA Kdeg KS[enzima] = Atividade catalítica • Controle alostérico • Proteínas alostéricas são aquelasque adquirem diferentes conformações induzidas pela ligação de moduladores. O mesmo conceito se aplica para as enzimas. •Os moduladores podem ser tanto inibidores como estimuladores. Homotrópico e heterotrópico Modelo de alosterismo: aspartato transcarbamilase (ATCase) Reação da ATCase. A enzima catalisa a condensação do carbamil fosfato e o aspartato para formar o N-carbamilaspartato, na síntese dos nucleotídeos de pirimidina. Síntese de nucleotídeos A B Carbomil fosfato Aspartato E1: ATCase E2 E3 Inibição por retroalimentação ou retroinibição •não se liga no sítio ativo, mas em um sítio regulatório C D CTP E4 E5 um sítio regulatório • Inibição do tipo alostérica Modificações covalentes Fosforilação Adenilação Uridilação ADP-ribosilação Metilação Fosforilação Proteínas quinases catalisam a adição de um grupo fosfato a resíduo de Ser, Thr ou Tyr, introduzindo um grupo volumoso e carregado em uma região que era apenas moderadamente polar. Desfosforilação Proteínas fosfatases catalisam a remoção de um grupo fosfato a resíduo de Ser, Thr ou Tyr. Regulação por proteólise de um precursor enzimático: - Digestão de proteínas no TGI - Coagulação sanguínea - Apoptose -Regulação hormonal Ativação de zimogênios por clivagem proteolítica A regulação por meio de uma quebra proteolítica é irreversível!!!!