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01/09/2011 1 Aula 4 Estrutura de aminoácidos e proteínas Universidade Federal de Pelotas Disciplina de Bioquímica São as macromoléculas mais abundantes nas células vivas. Elas ocorrem em todas as células e em todas as partes da estrutura celular. Possuem uma grande diversidade de tamanhos e exibem uma variedade de funções biológicas. 1. Características Gerais das Proteínas 2 2. Funções das Proteínas 3 Funções das Proteínas Enzimática Sistemas contráteis Imunidade Ex: lipases Ex: anticorpos Ex: actina e miosina 4 Funções das Proteínas Estrutural Transporte Hormonal Ex: insulina Ex: hemoglobina Ex: cabelos e unhas “Polímeros formados por unidades mais simples denominada de aminoácidos” Existem somente 20 tipos de aminoácidos na natureza: Proteínas com uma grande diversidade de propriedades e funções biológicas 3. Conceito de Proteína 5 Existem 20 tipos de aminoácidos encontradas na natureza: Asparagina Cisteína Glicina Glutamina Prolina Tiroxina Ácido aspártico Ácido glutâmico Alanina Histidina 4. Estrutura dos Aminoácidos 6 Arginina Fenilalanina Isoleucina Leucina Lisina Metionina Serina Treonina Triptofano Valina Aminoácidos não essenciais O corpo humano pode sintetizar Aminoácidos essenciais Não podem ser produzidos pelo corpo 01/09/2011 2 4.1 Estrutura química dos aminoácidos: Todos os aminoácidos possuem um átomo de carbono ligado a quatro grupos diferentes: grupo amino, um grupo carboxila, um hidrogênio e um grupo R. 7 8 Aminoácidos apolares: com cadeias laterais que não interagem com a água. Nas proteínas encontradas em solução aquosa esses aminoácidos agrupam-se no interior da proteína. 9 4.2 Classificação dos aminoácidos quanto a polaridade dos grupos R: Aminoácidos polares: com cadeias laterais que interagem com a água. 10 Nome dos aminoácidos possui uma abreviatura associada de três letras e um símbolo de uma letra: Glicina = Gly (G) Alanina = Ala (A) Prolina= Pro (P) Valina = Val (V) Leucina= Leu (L) Isoleucina= lle (I) Metionina= Met (M) Fenialanina = Phe (F) Tirosina= Try (Y) Triptofano= Trp (W) 11 4.3 Nomenclatura dos aminoácidos: Serina= Ser (S) Treonina= Thr (T) Cisteína= Cys (C) Aspargina= Asn (N) Glutamina= Gln (Q) Lisina= Lys (K ) Histidina= His (H) Arginina= Arg (R) Aspartato= Asp (D) Glutamato= Glu (E) Duas ou mais moléculas de aminoácidos podem ser unidas através de uma ligação peptídica levando a formação de proteínas: 12 4.4 Aminoácidos e a formação de proteínas: 01/09/2011 3 Ligação peptídica: ocorre entre o grupo amino de um aminoácido e o grupo carboxila do aminoácido seguinte Dois aminoácidos: dipeptídeo Três aminoácidos: Tripeptídeo Quatro aminoácidos: Tetrapeptídeo Cinco aminoácidos: Pentapeptídeo Oligopeptídeos: (pequeno número de aminoácidos) Polipeptídeos (grande número de aminoácidos) Proteínas (milhares de aminoácidos) 13 14 4.5 Características gerais de uma Cadeia Polipeptídica: Extremidade aminoterminal Extremidade carboxiterminal Peptídeos e polipeptídeos possuem diversos tamanhos e composições de aminoácidos característicos: 15 Os tipos de aminoácidos também variam de uma proteína para outra: 16 As proteínas podem ser compostas somente por aminoácidos ou podem conter outros grupos químicos associados (grupo prostético): 17 18 Mioglobina (Hemeproteína) Hemoglobina (Hemeproteína) 01/09/2011 4 Um pouco de história....... Em 1953 Frederick Sanger determinou a seqüência de aminoácidos da insulina Marco na história da bioquímica AS PROTEÍNAS TEM UMA SEQUÊNCIA DE AMINOÁCIDOS DEFINIDA Saber as seqüências de aminoácidos é importante: Elucidar o mecanismo de ação (enzimas) Conhecimento de patologias moleculares História evolutiva Seqüências de aminoácidos determinam as estruturas tridimensionais SEQUÊNCIA DE AMINOÁCIDOS = ESTRUTURA PRIMÁRIA DAS PROTEÍNAS 19 Estrutura primária Estrutura Secundária Estrutura Terciária Estrutura Quaternária 5. Estrutura de uma proteína 20 5.1. Estrutura primária - Seqüência de aminoácidos de uma proteína. Cada proteína possui um número e uma seqüência específica de aminoácidos. - A estrutura primária determina a estrutura tridimensional de uma proteína, portanto sua função biológica. 21 Importante em doenças genéticas que resultam de proteínas com seqüências anormais de aminoácidos: Ex: anemia falciforme As propriedades alteradas da hemoglobina resultam da substituição de um aminoácido valina em vez de glutamato. 22 23 5.2. Estrutura secundária - Refere-se a conformação local de algum porção do polipeptídeo. Alguns tipos de estrutura secundária são mais estáveis: α-hélice e as conformações β. 24 01/09/2011 5 5.2.1. α - Hélice - Consiste em uma porção da cadeia polipeptídica enrolada na forma de um espiral com as cadeia laterais dos aminoácidos estendendo-se para fora do eixo: 25 5.2.2. Conformação β - São conformações mais estendidas da cadeia - Pode ser composta por duas ou mais cadeia estendidas em formato em ziguezague 26 5.2.3. Dobras ou curvaturas β - Dobras ou voltas na qual a cadeia polipeptídica inverte sua direção. - São elementos de conexão entre a α-hélice ou conformação β. 27 28 5.3. Estrutura Terciária - Refere-se ao arranjo tridimensional de todos os átomos de uma proteína : 29 5.4. Estrutura Quaternária - Refere-se ao arranjo tridimensional de proteínas que tem mais de uma cadeia polipeptídica. 30 01/09/2011 6 - Estas cadeias polipeptídicas podem funcionar independentemente uma das outras ou trabalhar cooperativamente (Ex: Hemoglobina que possui quatro cadeias polipeptídicas). OBS: - Tanto a estrutura terciária e a estrutura quaternária são estabilizadas por ligações fracas Pontes de hidrogênio, Interações hidrofóbicas e Interações iônicas. 31 • Estrutura das proteínas 32 33 Resulta no desdobramento e na desorganização das estruturas secundárias e terciárias sem a hidrólise das ligações peptídicas: 6. Desnaturação protéica 34 Agentes desnaturantes de proteínas: Calor Extremos de pH Detergentes Solventes orgânicos (álcool ou acetona) Uréia 35 Consistem principalmente de um único tipo de estrutura secundária. Cadeia polipeptídicas mais estendidas. Fornecem suporte, forma e proteção externa. São insolúveis em água (grande quantidade de aminoácidos apolares). Exemplos: α-queratina Colágeno 7. Proteínas fibrosas 36 01/09/2011 7 As alfa queratinas evoluíram no sentido de serem resistentes. Encontrada no cabelo, unhas, cascos, chifres e na camada externa da pele. As alfa queratinas são formadas somente por alfa hélices. 7.1. α-queratina 37 O colágeno também evolui no sentido de ser resistente. Encontrado em cartilagens, tendões e na córnea dos olhos. Formado por alfa hélices. Três cadeias polipeptídicas se enovelam 7.2 Colágeno 38 A seqüência de aminoácidos no colágeno é Glicina - X- Prolina ou Glicina -X – Hidroxiprolina: 39 Defeitos genéticos relacionado a estrutura do colágeno: resultam na substituição do aminoácido glicina por outro qualquer. Osteogenesis imperfecta: formação óssea anormal em bebês 40 Síndrome de Ehlers Danlos: juntas frouxas 41 Consistem de vários tipos de estrutura secundária. Cadeias polipeptídicas aparecem de forma esférica ou globular. Tem função enzimática e regulatória. 8. Proteínas globulares42 01/09/2011 8 - Proteína ligante de oxigênio presente nas células musculares. - Função: armazenar oxigênio. - Abundante nos músculos de animais aquáticos. - Contém uma única cadeia polipeptídica de 153 aminoácidos (8 segmentos alfa hélice e dobras beta) e um grupo heme: 8.1 Mioglobina 43 - Componente da cadeia respiratória das mitocôndrias. - Apresenta uma única cadeia polipeptídica de 100 aminoácidos. - Contém estruturas em α-hélice, dobras β e segmentos enovelados e estendidos. - Contém um grupo heme. 8.2 Citocromo 44 - Enzima presente na clara de ovo e nas lágrimas. Atua como um agente bactericida. - Apresenta uma única cadeia polipeptídica de 129 aminoácidos. - Contém estruturas em α-hélice, conformações β e dobras β. 8.3 Lisozima 45 - Enzima secretada pelo pâncreas no interior do intestino delgado. - Apresenta uma cadeia polipeptídica de 124 aminoácidos. - Contém estruturas em α-hélice, conformações β e dobras β. 8.4 Ribonuclease 46 - Embora cada uma das proteínas tenha uma estrutura distinta adaptada para a função biológica em particular, elas apresentam várias propriedades comuns: - São enoveladas - Aminoácidos apolares se encontram no interior da proteína - Aminoácidos polares estão localizados na superfície. - Estabilizadas por interações fracas. Resumindo.... 47