Como saber qual a melhor metodologia de pesquisa usar quando for realizar alguma pesquisa?

Depende do obejto de estudo, a amostragem e o objetivo da pesquisa, se tu detalhar um pouco mais o que tu pretende fazer talvez eu possa te ajudar de forma mais atenta.

Acredito que as referências devam clarear a tua dúvida. A metodologia aplicada, independentemente se é uma pesquisa quantitativa e/ou qualitativa, pode variar. A literatura vai te apresentar algumas alternativas, então tu deve escolher alguma de acordo com a tua pesquisa. A que for mais adequada é a melhor.